L’Assemblée générale est l’organe de décision suprême de la Fédération. Elle se réunit tous les deux ans et se compose de représentants de toutes les Sociétés nationales membres. Il incombe à l’Assemblée générale de nommer le Secrétaire général, qui est le plus haut fonctionnaire responsable de la gestion de la Fédération et qui dirige le Secrétariat et ses délégations.

La dernière Assemblée générale a eu lieu à Seoul, en République de Corée, du 10 au 14 novembre 2005.

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